12月29日上午,应伟德betvlctor1946邀请,荷兰乌得勒支大学化学系助理教授薛莉在长清湖校区实验楼信息学院506会议室做了题目为《Artificial intelligence boosted 3D modelling of protein-protein complexes and the estimation of binding affinity changes upon mutations》的学术报告。报告会由学院副院长郑元杰教授主持,学院部分老师、博士、硕士研究生聆听了此次报告。
报告会上,薛莉教授首先从蛋白质三维结构的应用入手,向大家简单讲述了生物信息领域的部分概念以及存在的问题,引出了如何用机器学习的方法进行蛋白质分子对接。针对这个问题,她从样本量分析和合理性优化两个方面向我们介绍了蛋白质与蛋白质对接的方法,并指出其中应注意的问题。随后薛教授借助其团队研究的切身实例,具体分析阐述了蛋白质分子对接中得分函数的四种模型并详细介绍了其研究团队在预测蛋白质分子对接模型方法iSEE上所做的工作。此外,薛教授结合团队实验数据分析表明了其研究成果的准确性,并详细介绍了各项成果方法的目的、核心、优势及具体实现过程。最后,薛教授总结了其团队在生物信息研究方面所做的工作与贡献。薛教授的报告为从事生物信息研究、机器学习等方面研究的广大师生带来了启迪和指导。
报告会问答环节,薛教授和在座师生就报告内容展开了激烈的讨论,并对现场老师、学生提出的生物信息研究领域的相关问题做了认真解答。此次报告会,薛教授深入浅出的讲解赢得了在场师生们的阵阵掌声,我院师生对机器学习和生物信息方向研究有了更深的理解与认识,对今后的科学研究有着重要的指导意义,可谓受益匪浅。
薛莉,现任Utrecht University化学系助理教授,2012年在Iowa State University获得生物信息学博士学位,受荷兰国家Veni研究基金资助,在荷兰Utrecht University结构生物信息实验室(HADDOCK研究组,全球领先的蛋白质对接软件)担任博士后研究员。于2016年获荷兰深度学习研究基金(co-PI)。研究方向为机器学习、人工智能、数据挖掘、统计学、生物分子对接、生物分子界面分析和预测、计算结构生物学等。多年来致力于将人工智能与结构生物学结合,以便更好地了解疾病分子基础和进行合理化药物设计。在与多样性分子生物学相关的数据挖掘和机器学习领域中,有着十年以上的研究经历。